Денісоване: Розкриття таємниці черепа з Харбіна
Протягом майже століття потужний череп гомініда, знайдений у Харбіні, Китай, залишався в забутті. Лише у 2021 році палеоантропологи офіційно описали його як Homo longi (“Драконяча людина”). Тепер сучасні методи палеопротеоміки підтвердили, що цей майже ідеально збережений череп, віком 146,000 років, належить до денісованців — наших далеких родичів, відомих переважно з фрагментів ДНК.
Від «Драконячої людини» до денісованців
Череп з Харбіна демонструє мозаїку архаїчних і сучасних рис: довгий, низький череп (~1,420 см3 об’єм), виразні надочні валики, широкий, сплюснутий обличчя та масивні корінні зуби. Ці особливості спонукали Джі та ін. (2021) ввести новий вид H. longi. Однак відсутність геномних даних — невдалі спроби витягти стародавнє ДНК — залишила простір для дискусій.
“Новий генетичний матеріал перевірить зв’язки між цими популяціями”, зазначили автори 2021 року. Проте білки, які є більш стійкими, ніж ДНК, заповнили цю прогалину.
Покращення технологій палеопротеоміки
У дослідженні, опублікованому у червні 2025 року в журналі Science, Ні та ін. застосували рідинну хроматографію з тандемною мас-спектрометрією (LC-MS/MS) до зразків тимчасової кістки. З 95 ідентифікованих білків — переважно фрагментів колагену типу I альфа-1 та енамеліну — чотири містили поліморфізми амінокислот, характерні для денісованців. Три з них точно відповідали відомим варіантам денісованців, зафіксованим у геномах Алтаю та Тибету.
- Підготовка зразків: Неруйнівна дезінфекція за допомогою UV та EDTA.
- Секвенування пептидів: Сопоставлення спектрів за допомогою глибокого навчання за новим інструментом DeepPeptide (Макс Планк, 2024).
- Призначення ліній: Філогенетичне розміщення з використанням байєсівського датування з інтегрованим OpenMS.
Відновлення біології та поведінки денісованців
Окрім таксономії, череп з Харбіна надає уявлення про фізіологію та екологію. Міцний жувальний апарат свідчить про раціон, багатий на жорстку рослинність та, можливо, м’ясо — подібно до знахідок денісованців на високогір’ї Тибету, датованих приблизно 100 тисяч років тому. Товщина черепної коробки та структура диплоє свідчать про адаптацію до холодного клімату, що відображає геномні сигнали генів метаболізму жирних кислот (наприклад, кластер FADS), виявлені в ДНК денісованців, які були інтегровані в сучасні популяції Тибету на великій висоті.
Висновки для філогенієї гомінідів
Інтеграція даних з Харбіна уточнює нашу філогенетичну деревину гомінідів. Використовуючи комбіновані дані морфологічних та протеомних характеристик, байєсівські філогенії тепер розміщують денісованців як сестринську кладу до розділення неандертальців та H. sapiens приблизно 450 тисяч років тому. Це підтверджує геномні оцінки спільного предка, який існував майже півмільйона років тому.
Примарні лінії більше не існують
Денісованці — колись «примарна лінія» — виходять з тіні. Окрім черепа з Харбіна, подібні черепні фрагменти з Далі (200–260 тисяч років), печери Хуалонг (~300 тисяч років) та Цзиньнюйшань (~260 тисяч років) можуть свідчити про різноманітність денісованців. Попередні протеомні дослідження цих зразків вже розпочато в Китайській академії наук, з метою картографування географічної варіації по Східній Азії.
Напрями майбутніх досліджень
- Розширені палеопротеомні дослідження: Застосування оптимізованих протоколів демінералізації EDTA та nanoLC до додаткових китайських та південно-східноазійських скам’янілостей.
- Гібридне захоплення стародавнього ДНК: Поєднання цільових проб ДНК мітохондрій та ядерних з однонитковою підготовкою бібліотеки для відновлення низьковихідних послідовностей денісованців.
- Функціональна геноміка: Вивчення денісовант специфічних варіантів емалі та колагену in vitro для оцінки їх біомеханічних властивостей.
Висновки
Перекласифікація черепа з Харбіна як денісованця змінює наше розуміння архаїчної різноманітності людей. Це заповнює прогалину між фрагментарними генетичними даними та морфологією скам’янілостей, демонструючи потужність сучасної протеоміки. Як тільки дослідники почнуть застосовувати ці методи у всьому світі, можуть виникнути нові «примарні» популяції з минулого, що змінить уявлення про еволюцію людини.